Заедно с Чехия, Полша, Словакия, Северна Ирландия и Сан Марино, Словения попадна в една от малкото равностойни и оспорвани квалификационни групи, но след страхотна битка словенците достигнаха до Южна Африка.
Те направиха успешно начало, след като направиха равен с Полша и победиха Словакия и Северна Ирландия у дома, но след това нещата потръгнаха надолу. Взеха едва една точка от двата мача с Чехия, а след това загубиха в Северна Ирландия. Въпреки това, словенците успяха да се надигнат и записаха няколко убедителни поредни победи. Първо бяха надиграни Сан Марино и Полша у дома със съответно 5-0 и 3-0, а после удариха и Словакия с 2-0, като гост преди да завършат групата с 3:0 над Сан Марино. И така след като Чехия и Полша не успяха да изпълнят очакванията към тях, Словения завърши удобно на второ място в групата, на две точки зад Словакия, за да се класира на плейофите.
Смятани за аутсайдери в тяхната група, те бяха отписани от всички и за баража срещу отбора на Гуус Хидинк - Русия. Първият мач в Москва, се развиваше като по сценарий, след като Диняр Билялетдинов вкара на два пъти, и срещата вървеше към руски разгром. Но в последните секунди на мача, шут на Роберт Корен бе отклонен от влезлия като резерва Печник и Словения отбелязаха жизненоважно попадение. В реванша момчетата на Матиаш Кек направиха немислимото и гол на Златко Дедич изстреля словенците на втори Световни финали напук на всички коефициенти и очаквания.